Simptomai atsiranda tarp 10 ir 15 dienų po užkrėsto vabzdžio įkandimo. Tam tikros maliarijos parazitų rūšys (Plasmodium vivax et Plasmodium ovale) gali likti neaktyvus kepenyse savaites ar net mėnesius, kol pasirodys pirmieji požymiai.

Maliarijai būdingi pasikartojantys priepuoliai, susidedantys iš trijų fazių:

• Šaltkrėtis;
• Galvos skausmas;
• Nuovargis ir raumenų skausmas;
• Pykinimas ir vėmimas;
• Viduriavimas (kartais).

Po valandos ar dviejų valandų:

• Aukštas karščiavimas;
• Oda tampa karšta ir sausa.

Tada kūno temperatūra nukrenta:

• Gausus prakaitavimas;
• Nuovargis ir silpnumas;
• Nukentėjęs asmuo užmiega.

P. vivax ir P. ovale maliarijos infekcijos gali atsinaujinti praėjus kelioms savaitėms ar net mėnesiams po pirmojo užsikrėtimo, net jei pacientas paliko užkrėstą vietą. Šie nauji epizodai atsiranda dėl „miegančių“ kepenų formų.